2014-10-24-世界卫生组织-WHO_BS_2014.2248_An_International_Collaborative_Study_to_establish_a_WHO_Internal_Standard_for_Toxoplasma_gondii_DNA_Nucleic_acid_amplification_technology_assays_42页_625kb
报告摘要
总结:WHO国际标准建立研究 - Toxoplasma gondii DNA NAT检测方法
核心内容
本研究由世界卫生组织(WHO)发起,旨在建立一个国际标准,用于比较基于核酸扩增技术(NAT)的Toxoplasma gondii DNA检测方法的灵敏度。17家来自14个国家的实验室参与了该研究,共提供了20组数据。
主要观点
- 研究目的:评估候选材料作为WHO国际标准的适用性,并确定其DNA含量。
- 候选材料:包括5种样本(AA、BB、CC、DD、EE),其中AA为冻干样品,BB、CC、DD、EE为液态样品。
- 检测方法:使用多种NAT方法,包括实时PCR、定量PCR和定性终点PCR,以评估样本的DNA含量和灵敏度。
- 稳定性研究:样本AA在不同温度下(-20°C、+4°C、+20°C、+37°C)进行稳定性测试,结果显示无明显降解。
- 国际标准建议:基于研究数据和稳定性测试结果,建议将样本AA作为首个WHO国际标准用于Toxoplasma gondii DNA NAT检测,代码为10/242,建议效价为 $1 \times 10^6$ 国际单位/毫升。
关键信息
样本描述
| 样本 | 类型 | 制备方式 | 浓度(parasites/ml) |
|---|---|---|---|
| AA | 冻干样品 | 从小鼠中提取速殖子,冻干 | 约 $1 \times 10^6$ |
| BB | 液态样品 | 用于制备AA的原始液态材料 | 约 $1 \times 10^6$ |
| CC | 液态样品 | AA的1:1000稀释,含脑脊液 | 约 $1 \times 10^3$ |
| DD | 液态样品 | AA的1:1000稀释,含羊水 | 约 $1 \times 10^3$ |
| EE | 液态样品 | RH株速殖子,从组织培养细胞中提取 | 约 $2.4 \times 10^6$ |
样本稳定性研究结果
| 时间(月) | 温度(°C) | 效价(相对-70°C) |
|---|---|---|
| 12 | -20 | 0.6807 |
| 12 | 4 | 0.7389 |
| 12 | 20 | 1.4551 |
| 12 | 37 | 1.4158 |
| 18 | -20 | 0.8286 |
| 18 | 4 | 0.9396 |
| 18 | 20 | 0.8508 |
| 18 | 37 | 0.9030 |
| 30 | -20 | 0.8092 |
| 30 | 4 | 0.7768 |
| 30 | 20 | 0.7413 |
| 30 | 37 | 0.7768 |
- 样本AA在不同温度下保持稳定,无明显降解。
- 样本AA的残余水分含量为0.2667%,氧气含量为0.45%。
数据分析与结果
- 定量检测:6家实验室提供了定量数据,其中3家基于本地参考估计寄生虫数,另外3家仅提供Ct值。
- 定性检测:11家实验室提供了定性数据,基于终点PCR检测结果。
- 总体平均值:
- 样本AA的平均 $\log_{10}$ 寄生虫数为6.0。
- 样本BB为5.91,CC为2.88,DD为3.01,EE为6.48。
- NAT检测单位:
- 样本AA的平均 $\log_{10}$ NAT检测单位为7.47。
- 样本BB为7.25,CC为4.15,DD为4.42,EE为7.70。
- 实验室间差异:
- 对于样本CC和DD,实验室间差异较大,最大达0.8 log。
- 样本AA和BB的总体平均值非常接近(6.12和6.13 log)。
- 实验室14对样本AA和BB的估计值较高,而其他样本则差异较大。
检测方法分析
- 定量方法:基于Ct值与浓度的平行线分析,实验室间一致性较好,尤其是样本BB。
- 定性方法:使用Poisson模型分析终点PCR数据,但结果存在较大变异,尤其是样本CC和DD。
- 实验室13:因使用不同方法进行不同样本的检测,其结果与其他实验室差异显著,可能影响最终效价评估。
效价计算
- 效价基于样本AA的 $\log_{10}$ NAT检测单位(假设为 $6.0 \log_{10}$),并根据实验室数据进行相对比较。
- 效价估计值在不同方法间基本一致,但实验室13的样本CC和DD的估计值与其他实验室相差1000倍,存在争议。
结论
- 样本AA在稳定性研究中表现优异,适合作为首个WHO国际标准用于Toxoplasma gondii DNA NAT检测。
- 实验室间存在一定的检测方法差异,影响结果的一致性。
- 本研究为NAT检测方法的标准化提供了重要参考,有助于提高检测的一致性和可靠性。
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