20200219-ChemBioChem-Learning_from_the_Past__Possible_Urgent_Prevention_and_Treatment_Options_for_Severe_Acute_Respiratory_Infections_Caused_by_2019-nCoV_24页_2mb
报告摘要
总结:2019-nCoV严重急性呼吸系统感染的潜在预防和治疗选项
核心内容
本文探讨了2019-nCoV(新型冠状病毒)与SARS-CoV(严重急性呼吸综合征冠状病毒)在结构和功能上的相似性,并基于这些相似性提出了几种可能用于预防和治疗2019-nCoV的药物候选物。文章重点分析了病毒的关键蛋白(如Spike蛋白、RdRp、3CLpro和PLpro)与宿主细胞的相互作用机制,以及已有的抗SARS-CoV药物在对抗2019-nCoV中的潜在应用。
主要观点
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病毒与SARS-CoV的相似性:
- 2019-nCoV与SARS-CoV在基因组序列上具有82%的同源性,部分关键酶(如RdRp和3CLpro)的同源性超过95%。
- 这种高度保守性意味着针对SARS-CoV开发的药物可能对2019-nCoV有效。
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Spike蛋白与ACE2的相互作用:
- Spike蛋白是2019-nCoV进入宿主细胞的关键,其受体结合域(RBD)与ACE2有高亲和力结合。
- 2019-nCoV的RBD与SARS-CoV的RBD在结构上存在差异,可能影响其与ACE2的结合能力。
- 尽管当前认为2019-nCoV的RBD与ACE2结合较弱,但其结构的可变性可能导致新的更强的结合方式。
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潜在的治疗药物候选物:
- ACE2基肽:基于ACE2的肽可以用于阻断Spike蛋白与ACE2的结合,从而抑制病毒感染。
- 瑞德西韦(Remdesivir):一种核苷类似物,已被证明对SARS和MERS具有抗病毒活性,可能对2019-nCoV有效。
- 3CLpro-1:一种针对3CLpro的抑制剂,具有较高的抑制活性,可能对2019-nCoV有效。
- 新型乙烯砜类蛋白酶抑制剂:这类小分子药物可能对2019-nCoV的3CLpro和PLpro具有抑制作用。
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药物开发策略:
- 利用已有的抗SARS-CoV药物研究结果,快速开发针对2019-nCoV的药物。
- 鼓励使用组合疗法,即多种药物联合使用,以提高疗效并减少耐药性。
- 建议利用宏环肽库快速筛选出针对2019-nCoV Spike蛋白的新型治疗肽。
关键信息
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2019-nCoV的Spike蛋白:
- 与SARS-CoV的Spike蛋白具有76%的序列同源性。
- 与ACE2的结合区域(RBD)在结构上存在显著差异,可能影响其感染能力。
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RdRp蛋白:
- 2019-nCoV和SARS-CoV的RdRp具有96%的序列同源性。
- 瑞德西韦是一种有效的RdRp抑制剂,已被用于临床试验。
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3CLpro蛋白:
- 2019-nCoV和SARS-CoV的3CLpro具有96%的序列同源性。
- 已有多种小分子抑制剂,其中3CLpro-1具有200 nM的抑制活性。
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PLpro蛋白:
- 与SARS-CoV的PLpro具有83%的序列同源性,但其结构较为保守。
- 针对PLpro的抑制剂可能对2019-nCoV有效。
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研究建议:
- 需要尽快确定2019-nCoV-RBD-ACE2复合物的结构,以更准确地评估其与SARS-CoV的结合能力。
- 建议利用现有的抗SARS药物进行再利用(repurposing),并开发针对2019-nCoV的新型药物。
结论
2019-nCoV与SARS-CoV在关键蛋白上具有高度同源性,因此可以借鉴SARS-CoV的研究成果来开发针对2019-nCoV的药物。文章建议利用已有的药物(如瑞德西韦、3CLpro-1)以及新型蛋白酶抑制剂,作为2019-nCoV的潜在治疗药物。同时,基于Spike蛋白的肽抑制剂和宏环肽库的应用,也为快速开发新的抗病毒药物提供了方向。
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